RESUMEN Introducción: En Paraguay y en otras partes del mundo el Streptococcus pneumoniae es el principal agente causante de neumonía bacteriana, otitis media, meningitis y septicemia. Objetivo: Describir las características clínico-epidemiológicas de pacientes con enfermedad invasiva por Streptococcus pneumoniae atendidos en el Instituto de Medicina Tropical (IMT) durante los años 2016 al 2019. Metodología: Estudio observacional, descriptivo, transversal. Se incluyeron a todos los pacientes con enfermedad invasiva por Streptococcus pneumoniae confirmada. Resultados: Fueron incluidos 34 pacientes, la edad promedio fue de 44años, 76% fueron varones, 61% diagnóstico de infección por VIH. El foco infeccioso predominante fue el pulmonar. De las muestras biológicas con cultivos positivos, el 73% fueron aislados en sangre, y los restantes distribuidos entre muestras de esputo, líquido ceflorraquideo y liquido pleural. El 24% de los pacientes presentaron complicaciones, entre falla orgánica (15%) y empiema (9%). El 59% de los pacientes recibió tratamiento con cefalosporinas. La mortalidad intrahospitalaria registrada fue del 18%.Conclusión: Los pacientes con enfermedad invasiva que acudieron al IMT durante los años 2016 al 2019 fueron en su mayoría adultos jóvenes, inmunosuprimidos, con neumonía.