Resumen Introducción: Las comunidades de macroalgas marinas del Parque Nacional Guanahacabibes no han sido estudiadas desde el punto de vista cuantitativo, a pesar de la influencia que la vegetación submarina tiene sobre la estructura y el funcionamiento de los ecosistemas costeros, componente que hasta ahora ha sido subestimado en la región. Objetivo: Evaluar la variación temporal y espacial de los géneros de macroalgas en dos sitios de María La Gorda, sur del Parque Nacional de Guanahacabibes, y evaluar la salud del arrecife de acuerdo con la cobertura de los diferentes morfo-tipos de macroalgas predominantes. Metodología: El muestreo fue cuatrimestral entre febrero 2014 y marzo 2017 en Yemayá y Laberinto, mediante buceo autónomo a una profundidad de 10 m. La cobertura algal fue estimada siguiendo la metodología AGRRA. Se usaron ocho transectos de 20 m por sitio de muestreo de acuerdo con las condiciones del arrecife y la forma del fondo. Cada cinco metros se colocó un cuadrante de 25 x 25 cm. Se calculó el porcentaje de cobertura que aporta cada género y de los grupos morfofuncionales a la cobertura total. Resultados: Los géneros dominantes durante el periodo de estudio fueron: Dictyota, Lobophora y Halimeda. Las algas carnosas y calcáreas mostraron mayor cubrimiento en Laberinto (carnosas= 57.8 ±15.6; calcáreas = 8.3 ± 6.8) que en Yemayá, (carnosas = 47.3 ± 23.1; calcáreas = 8.5 ± 9.3). Las formas costrosas son más abundantes en Yemayá (17.1 ± 15.1) que en Laberinto (7.7 ± 10). El índice de las carnosas fue superior en Laberinto (225.7 ± 110.2). Conclusión: La disminución en los niveles de cobertura de algas costrosas y la dominancia de formas carnosas como Dictyota y Lobophora en la zona de estudio, evidencian el deterioro en ambos sitios, a pesar de las políticas de conservación de parques nacionales.