Resumen El Oro incluye diferentes sistemas costeros y estuarinos y es parte del Golfo de Guayaquil. Estas áreas proporcionan diferentes servicios ecosistémicos, pero con el aumento de la población y de las diversas actividades económicas, los recursos naturales locales poco estudiados pueden verse afectados negativamente. Es por ello que esta investigación tuvo como objetivo describir la dinámica del plancton, productividad y ecológica de esta área durante la estación seca de 2012, para lo cual se establecieron 17 estaciones para estudiar la distribución espacial y variación mensual de los nutrientes inorgánicos, temperatura, oxígeno disuelto, salinidad, zona fótica, abundancia y composición del plancton y larvas de peces, con métodos estándar. Se establecieron patrones espaciales y temporales mediante análisis de conglomerados y de ordenamiento multidimensional. Los resultados obtenidos de las variables bióticas y abióticas analizadas determinaron un patrón característico de un ecosistema estuarino productivo, así como también la existencia de áreas específicas asociadas a condiciones naturales y antrópicas, que son: a) interior del Archipiélago de Jambelí y frente a la isla Puná, influenciada por las actividades productivas y la hidrografía del área; b) una zona, conformada por las estaciones ubicadas en el estuario exterior donde la influencia oceánica es evidente y c) el canal de Jambelí, caracterizado por procesos de mezcla producto del flujo de mareas. Lo que se evidenció en la presencia de fitoplancton oceánico, nerítico y estuarino; copépodos con distribución uniforme en el área de estudio y dominancia de la familia Engraulidae representativa en este tipo de ecosistema acuático en lo referente a larvas de peces. Temporalmente, mayo registró precipitaciones que excedieron los valores normales, lo que habría determinado las altas concentraciones de nutrientes, la disminución de salinidad y de la zona fótica, registradas en este mes. Sin embargo la disponibilidad de nutrientes existente permitió a lo largo de todo el período de estudio mantener la composición y abundancia del fitoplancton con alternancia de especies representativas y que el zooplancton registre periodos de mayor (junio a agosto) y menor (octubre a diciembre) abundancia, lo que sería resultado de patrones poblacionales específicos de las especies presentes e influencia de la marea y flujos del río aportante; comportamiento similar registró el ictioplancton resultado de las concentraciones de Anchoa macrolepidota, especie característica de este ecosistema. Estos patrones de distribución espacio-temporal, permiten establecer el desarrollo de múltiples interacciones abióticas y bióticas que determinan diferentes estrategias para mantener la productividad del área, por lo que se recomienda desarrollar esta investigación durante la estación lluviosa en el Ecuador.