El presente estudio in Vitro pretende comparar la cantidad de dentina removida al utilizar dos sistemas rotatorios mecanizados, ProTaper y AET, cuando son utilizados en la preparación de los dos tercios coronarios de los conductos radiculares. Para esto se recolectó una muestra de 22 primeros molares inferiores, utilizando para el estudio los conductos vestibulares y linguales de las raíces mesiales. Se construyeron 22 cuerpos de prueba utilizando el cubo de Kuttler, luego se realizaron cortes a 3 y 5 mm de la entrada de los conductos y mediante una lupa estereoscópica fueron observados y fotografiados, obteniéndose fotografías preinstrumentación. Los conductos vestibulares y linguales de la raíz mesial se distribuyeron aleatoriamente en dos grupos los cuales fueron instrumentados con cada sistema. Un grupo fue instrumentado con el sistema Protaper y el otro grupo con el sistema AET según las indicaciones del fabricante. Se obtuvieron fotografías postinstrumentación las cuales junto con las fotografías preinstrumentación, fueron analizadas en programa AUTOCAD 2004 obteniéndose áreas de pre y postinstrumentaciòn. Posteriormente los datos obtenidos se sometieron a análisis estadístico mediante el t-test de Student, fijándose el nivel de significancia estadística p<0,05. Se concluyó que el sistema ProTaper removió mayor cantidad de dentina que el sistema AET.