Trabajo de grado - Maestría
Historia evolutiva y estructura genética poblacional de Rhaebo Colomai (AMPHIBIA: BUFONIDAE), una especie amenazada de Colombia y Ecuador
Registration in:
Universidad de Caldas
Repositorio Institucional Universidad de Caldas
Author
Rojas Rivera, María Alejandra
Institutions
Abstract
Ilustraciones, fotos, mapas, gráficas spa:Las condiciones climáticas durante el Plioceno y el Pleistoceno afectaron la distribución, la diversificación y la dinámica demográfica de los anfibios. Bajo esta premisa, combinamos secuencias genéticas junto con reconstrucciones paleoclimáticas para evaluar el impacto de esas oscilaciones sobre la biogeografía y demografía histórica del anuro Rhaebo colomai. Adicionalmente, evaluamos la variabilidad y la estructura genética de esta especie presente en la Reserva Natural Río Ñambí (Nariño, Colombia - RNRÑ), utilizando secuencias del gen mitocondrial COI de individuos recolectados en cuatro transectos (tres quebradas y un bosque), separados entre sí por distancias lineales entre 170-495 m. Rhaebo colomai divergió de su especie hermana (R. olallai) hace ~3.1 M.a. durante el Plioceno en el área ancestral del sur de los Andes del Norte en Ecuador. El área de distribución de R. colomai en la zona ecuatorial se comprimió durante el Last Glacial Maximum (34750–27900) formando refugios, en los cuales esta especie sobrevivió. Posteriormente, ocurrió un evento de dispersión desde el área ancestral hacia Colombia, donde la población de R. colomai en la RNRÑ experimentó una expansión demográfica que inició hace ~12 980 años. Las secuencias genéticas analizadas de 40 individuos de Ñambí mostraron una variabilidad genética total baja (H = 0.276; π = 0.00238) y un flujo génico restricto entre los individuos de la quebrada dos y los demás sitios de muestreo debido probablemente a la presencia de una franja de bosque amplia (2.9 ha) con una pendiente un poco pronunciada que podría estar limitando el movimiento de los individuos hacia los demás transectos. eng:We combine genetic sequences with paleoclimatic reconstructions to evaluate the impact of the conditions climatic during the Pleistocene and Pliocene on the biogeography and historical demography of Rhaebo colomai. Additionally, we evaluated the variability and genetic structure of this species present in the Reserva Natural Río Ñambí (Nariño, Colombia - RNRÑ), using COI mtDNA from individuals collected in four transects (three streams and one forest), separated from each other by linear distances between 170-495 m. Rhaebo colomai diverged from its sister species (R. olallai) ~3.1 Mya ago during the Pliocene in the southern ancestral area of the Northern Andes in Ecuador. The distribution area of R. colomai in the Ecuadorian region was compressed during the Last Glacial Maximum (~35–28 ka) forming refugia, in which this species survived. Subsequently, a dispersal event occurred from the ancestral area to Colombia. Rhaebo colomai in the RNRÑ experienced a demographic expansion that began ~13 ka. The species showed a low total genetic variability and a restricted gene flow between the individuals from one of the streams and those of the other transects, probably due to the presence of a wide strip of forest with a slightly steep slope that could be limiting the movement of individuals. INTRODUCCIÓN GENERAL / BIBLIOGRAFÍA / CAPÍTULO 1. Historia evolutiva y estructura genética poblacional de Rhaebo colomai (Amphibia: Bufonidae), una especie amenazada de Colombia y Ecuador / RESUMEN / 1. INTRODUCCIÓN / 2. MATERIALES Y MÉTODOS / 2.1. Área de estudio / 2.2. Recolección, extracción y amplificación de muestras / 2.3. Historia evolutiva / Tiempos de divergencia y reconstrucción de áreas ancestrales / Historia demográfica / Modelamiento de nicho / 2.4. Estructuración genética y variabilidad poblacional de Rhaebo colomai en Colombia / 3. RESULTADOS / 3.1. Historia evolutiva / Tiempos de divergencia y reconstrucción de áreas ancestrales / Historia demográfica / Modelamiento de nicho / 3.2. Estructuración genética y variabilidad poblacional de Rhaebo colomai en Colombia / 4. DISCUSIÓN / 4.1. Historia evolutiva / 4.2. Estructuración genética y variabilidad poblacional de Rhaebo colomai en Colombia / 4.3. Implicaciones para la conservación / 5. BIBLIOGRAFÍA / 6. MATERIAL SUPLEMENTARIO / 6.1. Tabla S1. Secuencias de especies y números de acceso en el GenBank Maestría Magister en Ciencias Biológicas Ecología de Anfibios y reptiles