El frijol común (Phaseolus vulgaris L.) principal fuente de proteína en Centro América y El Caribe. La pudrición gris del tallo causada por Macrophomina phaseolina es una de las enfermedades emergentes en la región, favorecida por el incremento en la frecuencia de períodos de estrés de sequía y de la temperatura. El objetivo del estudio fue validar técnicas para el aislamiento y caracterización de la patogenicidad de M. phaseolina en frijol común, para su uso en el mejoramiento genético de la resistencia a esta enfermedad. En la prueba de patogenicidad de 34 aislamientos puros a partir de 40 muestras con síntomas típicos de la enfermedad procedentes de Zamorano y Nacaome, se seleccionaron los dos aislamientos más patogénicos (Mph-9 y Mph-32). Estos dos aislamientos fueron utilizados para evaluar las técnicas de inoculación con arroz blanco, palillos de dientes y PDA en 10 genotipos de frijol, y en casa de malla y camas de infección. Se presentaron variaciones en la reacción a la inoculación, expresada en severidad de daño en los genotipos de frijol, debidas a los aislamientos, técnicas de inoculación y ambientes, e interacciones entre los genotipos y cada uno de estos factores. Se recomienda evaluar un mayor número de aislamientos patogénicos y técnicas de inoculación, para desarrollar un protocolo efectivo para el mejoramiento genético de la resistencia a la pudrición gris del tallo en frijol común.