Plântulas de Cybistax antisyphilitica (ipê-verde), espécie arbórea que ocorre no Estado de São Paulo, Brasil, foram estudadas morfoanatomicamente e citogeneticamente. As plântulas são eudicotiledôneas, fanerocotiledonares e epigéias. Suas sementes apresentam alas hialinas, assimétricas e de textura papirácea. A raiz é axial com tecido epidérmico irregular. O hipocótilo é verde, glabro e apresenta os elementos do xilema em diferenciação. Os cotilédones são verdes, foliáceos, reniformes, com mesofilo heterogêneo, epiderme pilosa e feixes vasculares colaterais. Os eófilos são glabros, peciolados, de filotaxia oposta, dorsiventrais, hipoestomáticos e possuem mesofilo heterogêneo e assimétrico. Não há diferenças anatômicas significativas entre os eófilos e os metáfilos. O sistema vascular do pecíolo dos metáfilos dispõe-se em forma de ferradura. A espécie apresenta número cromossômico mitótico 2n = 40 com comprimento cromossômico geral médio de 1,042 µm ± 0,140 e amplitude variando de 0,58 µm até 1,60 µm.Seedlings of Cybistax antisyphilitica (ipê-verde), a tree species found in the state of São Paulo, Brazil, were studied as regards morphology, anatomy and cytogenetics. The seedlings are eudicotyledonous, phanerocotylar, epigeous and the seeds have hyaline, asymmetric, paper-textured expansions. The root system is axial with irregular epidermal tissue. The hypocotyl is green, glabrous and has differentiated xylem elements. The cotyledons are green, foliaceous, kidney-shaped, with heterogeneous mesophyll, pilose epidermis and collateral vascular bundles. The eophylls are petiolate, glabrous, with opposite phyllotaxy, dorsiventral, hypostomatic and with heterogeneous, asymmetric mesophyll. There are no significant anatomical differences between eophylls and metaphylls. The metaphyll petiole vascular system is shaped like a horseshoe. The species has a mitotic chromosome number 2n = 40 with average overall chromosome length of 1.042 µm ± 0.140 and width varying from 0.58 µm to 1.60 µm.