Durante los últimos años se ha identificado la actividad marítima como una fuente importante de emisión de contaminantes atmosféricos, de los que se ha comprobado el alto impacto sobre el medio ambiente y la salud humana, principalmente en las ciudades costeras y las regiones fluviales. Las emisiones generadas dependen principalmente del modo operativo del buque (Hotelling, Maniobras y Cruising) y la calidad del combustible usado. En este sentido, resulta preocupante la falta de estudios en el territorio colombiano, más aún cuando este no dispone de mecanismos de control a causa de una legislación nula en materia emisiones ambientales para estas fuentes. Ante esta ausencia, el presente trabajo busca generar información cuantitativa a través de la estimación de emisiones de: SO2, NOx, Material Particulado (PM10, PM2,5), Hidrocarburos (HC), Compuestos Orgánicos Volátiles (VOC), CO, CO2, CH4, y N2O, utilizando la metodología “Bottom up” para las embarcaciones tipo Conteiner, Granel y Carga general arribadas al Terminal Fluvial de Barranquilla durante todo el año 2018, con el fin de hacer un diagnóstico preliminar de la situación actual del puerto. Para el año de estudio, se observó que arribaron un total de 651 motonaves, de las cuales se determinaron como emisiones totales: 4583,18 ton de NOx, 1417,34 ton de SO2, 182,52 ton de PM10, 179,42 ton de PM2,5, 87,10 ton de HC, 155,84 ton de Compuestos Orgánicos Volátiles diferentes a Metano (MNVOC), 136, 19 ton de CO, 105 677,85 ton de CO2, 0,77 ton de CH4 y 4,95 ton de N2O.