La Colección de Microorganismos del Departamento de Microbiología de la Pontificia Universidad Javeriana fue organizada con el fin de realizar actividades de conservación de cepas microbianas que apoyaran la enseñanza en docencia e investigación, promoviendo la preservación de microorganismos con interés Biotecnológico, Ambiental, Clínico e Industrial, fundada en 2001, y haciendo parte de la Federación Mundial de Colecciones de Cultivos (Rey & Trespalacios, 2013). La colección subdivide sus actividades según los microorganismos a conservar, con el fin de establecer de manera adecuada el manejo y la elaboración de las actividades.