Tesis Doctorado
Efecto de la precipitación acida de nitrógeno reactivo sobre la diversidad genética y funciónal de la microbióta bacteriana de suelos aridos.
Autor
Orlando, Julieta Laura
Institución
Resumen
La biogeoquímica global incluye numerosos procesos microbianos, los cuales dependen de
diversos factores tanto bióticos como abióticos, entre ellos la disponibilidad de agua, de
nutrientes como el nitrógeno y de la diversidad genética y funcional de la microbiota. Estos
factores son limitantes para la productividad de muchos suelos, en especial en ecosistemas
áridos y semiáridos donde se postula que, por su dependencia del régimen de
precipitaciones, responderían rápidamente a los efectos del cambio climático. También se ha
sugerido que estos ecosistemas serían más sensibles al ingreso o pérdida de nutrientes, como
el nitrógeno, el cual podría modificar tanto la actividad como la diversidad de los grupos
bacterianos que gobiernan este ciclo, especialmente por el considerable aumento global de
Nitrógeno reactivo (Nr) en la biosfera, durante el último siglo, debido a la acción
antropogénica. Una fracción de este Nr forma parte de la contaminación atmosférica, donde
tiene un corto tiempo de residencia y la mayoría retorna al suelo en forma de precipitación
ácida de Nr (nitrato y amonio). El ciclo del nitrógeno involucra diversas reacciones de
óxido-reducción, como la fijación que reduce el nitrógeno atmosférico a amonio. Luego,
durante la nitrificación, el amonio es oxidado a nitrato, el cual es posteriormente reducido a
nitrógeno elemental mediante desnitrificación. En el suelo, los contenidos de amonio y
nitrato dependen principalmente de estos procesos microbiológicos, realizados por grupos
bacterianos específicos conocidos como fijadores de nitrógeno, nitrificadores y
desnitrificadores. En consideración a lo anterior, este trabajo propuso evaluar el efecto de la precipitación ácida de Nr sobre la diversidad genética y funcional de la comunidad
bacteriana del suelo y cómo esta respuesta es mediada por el grado de aridez. Para ello se
realizaron ensayos a nivel de microcosmos, incubados durante 84 días, con suelo árido
proveniente del desierto de Atacama y suelo semiárido del matorral esclerófilo de Chile
Central. Se evaluó el efecto del Nr ácido sobre los parámetros edáficos, las actividades
microbianas de los grupos funcionales del ciclo del nitrógeno, la diversidad genética de
nitrificadores y sobre la diversidad genética y metabólica de la comunidad bacteriana total.
Paralelamente, mediante la construcción de genotecas con marcadores moleculares para
cada grupo, se determinó la composición de la comunidad bacteriana total (rDNA 1 6S), de
los nitrificadores (amoA) y desnitrificadores (nirK y nirS).
Los resultados indicaron que el suelo árido del desierto mostró mayor riqueza del rDNA 1 6S
que el suelo del matorral semiárido, concordando con la postulación de que la falta de agua
podría limitar la comunicación entre microhábitats, resultando en una mayor heterogeneidad
espacial que disminuiría o anularía el efecto de la competencia. En ambos tipos de suelos,
los clones del gen amoA se agruparon exclusivamente con bacterias del género Nitrosospira,
sugiriendo que la nitrificación se trataría de una función poco redundante. En el suelo
semiárido la diversidad genética del gen nirS fue mayor que la del gen nirK. Sin embargo,
todos los clones del gen nirK se relacionaron con secuencias de clones ambientales o
formaron grupos independientes sugiriendo una composición particular en estos suelos. Por
el contrario, en el suelo árido no se detectó la presencia de genes de desnitrificadores,
probablemente debido a una baja abundancia de este gremio bacteriano. PFCHA-Becas Doctor en Ciencias Mención en Microbiología 141p. PFCHA-Becas TERMINADA