Tesis Doctorado
Caracterización molecular de los aislados de gflv, glrav-2, grrspav y deteccióny caracterización molecular de los viroides presentes en la vid en Chile
Autor
Zamorano-Carrasco, Alan Gerardo
Institución
Resumen
La vid (Vitis vinifera L.) es el cultivo frutal más importante del país. La productividad se reduce a causa de enfermedades de origen viral o viroidal, cuyo control se basa exclusivamenteen la prevención. El objetivo del presente trabajo fue caracterizar molecularmente los principales virus que infectan a la vid en Chile, tales como Grapevine fanleaf virus (GFLV), Grapevine leafroll-associated virus-2 (GLRaV-2) y Grapevine rupestris stem pitting-associated virus(GRSPa V), generando así informaciones que contribuyan a la optimización de técnicas de detección de los virus para ser aplicadas en el país. También se realizó una identificación y caracterización de los viroides Grapevine yellow speckle viroid-1 (GYSVd-1), Grapevine yellowspeckle viroid-2 (GYSVd-2), Citrus exocortis viroid (CEVd), Hop stunt viroid (HSVd), Australian grapevine viro id (AGV d) asociados a la vid en el mundo y que nunca han sido identificados en Chile. Se diseñaron sondas específicas para la detección de GFLV, GLRaV-2 y GRSPaV a través de hibridación molecular no radioactiva (HM). Las mismas muestras seanalizaron también con RT-PCR tradicional y RT-PCR en tiempo real, confirmando en lamayoría de los casos la detección por HM. La variabilidad observada para GFL V y GLRa V -2 permitió identificar dos nuevos grupos filo genéticos (Ch1 y Ch2 para GFL V; ChA y ChB para GLRaV-2) formados exclusivamente por los aislados chilenos. GRSPaV no presentó variaciones en los grupos previamente indicado en literatura. En este trabajo se detectó por primera vez en Chile los viroides AGVd, GYSVd-1 y 2 y HSVd, asociados a la vid. La caracterización de estos viroides no mostró diferencias genéticas condicionadas por la distribución geográfica.La información de secuencias nucleotídicas obtenida de los aislados chilenos de GFL Vpermitió el diseño de una nueva sonda de detección por Real time RT-PCR, cuya eficiencia es mucho mayor que la sonda propuesta por la literatura.La información obtenida muestra la necesidad de obtener secuencias nacionales de los patógenos para optimizar los protocolos de detección específicos. PFCHA-Becas Doctor en Ciencias Silvoagropecuarias y Veterinarias 76p. PFCHA-Becas TERMINADA