La presente investigación aborda un estudio de la contaminación de las aguas del estero Citayacu que vierte sus aguas al río Puyo. El estero es contaminado por las aguas residuales domésticas originadas por los habitantes del lugar que son vertidas a él sin tratamiento alguno. Se realiza en primer lugar una caracterización de la zona y un diagnóstico que permitieron detectar la problemática existente, se realizó un estudio y caracterización físico química tanto de las aguas residuales como las del estero de la zona objeto de estudio para establecer el nivel de contaminación que presenta el mismo, a partir de los cuales se pudo determinar la afectación a la calidad ambiental que se produce como consecuencia de los vertimientos. Se monitoreó el comportamiento de los flujos de las aguas residuales y con los resultados obtenidos se procede a establecer cuál es el sistema de tratamiento más idóneo para tratar éstas aguas, llegándose a la propuesta de una combinación de tanque séptico y filtro anaerobio