La "Evaluación de progenies de naranjilla (Solanum quitoense Lam.)" A partir de cruces interespecíficos, tuvo como objetivo de evaluar y seleccionar las plantas con una alta productividad, la calidad comercial de frutas y la resistencia / tolerancia a las plagas y enfermedades, esta investigación se realizó en el Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuarias (INIAP), Granja Experimental Palora, provincia de Morona Santiago, cantón Palora, se encuentra a 887 msnm. Plagas y enfermedades han causado una disminución en la producción de naranjillas, la alta susceptibilidad de las variedades cultivadas en la incidencia de nematodos M. incognita y F. oxysporum. Esto ha provocado, que muchos de los agricultores, usen plaguicidas tóxicos para la salud humana, la búsqueda de productos alternativos, la tala indiscriminada de los bosques en busca de la tierra libre de patógenos y el aumento de la fertilidad. El programa de producción de frutas, INIAP, ha ido desarrollando a través de las tecnologías de reproducción (cruces) con especies silvestres de S. hyporhodium, S. vestissimum que son resistentes a los nematodos y F. oxysporum, pretendiendo encontrar materiales promisorios. Con la ayuda del programa R. versión 3.1, se realizó un análisis estadístico de la caracterización agro-morfológica de los grupos, la búsqueda de la variabilidad genética entre la segregación de naranjilla, el promedio para el Grupo 1 tiene un inicio de la floración de 76,678 días, la madurez fisiológica de las frutas 208,749 días, altura de la planta 138, 984 cm; 8, 473 flores por inflorescencia, peso promedio del fruto 139,05 gramos, con un rendimiento de 4,680 kilogramos por planta, sin espinas, la pulpa del fruto es de color verde oscuro, forma del fruto es esférico. Grupo 3 tiene un inicio de 76,907 días de la floración, madurez fisiológica de los frutos 237.337 días, la altura de las plantas 124 568 cm, 7.236 flores por inflorescencia, peso promedio del fruto 100,84 gramos, con un rendimiento de 2.680 kilogramos por planta, sin espinas, el fruto la pulpa es de color verde oscuro, forma del fruto es esférico. El inicio de la floración grupo 4 es 79,673 días, madurez fisiológica de los frutos 210,449 días, altura de la planta 153,398 cm, con 5,823 flores por inflorescencia, peso promedio del fruto 103,52 gramos, rendimiento por planta 3,392 kg, sin espinas, la pulpa del fruto es de color verde oscuro color, forma del fruto es esférico. Como resultado de esta investigación, los grupos con mayor resistencia / tolerancia a las plagas, los materiales seleccionados son los siguientes: Grupo 1, S. quitoense var. Baeza x S x S. quitoense vestissimum, plantas resistentes a F. oxysporum, y el 85,71% de las plantas resistentes a M. incognita también fueron resistentes a Phytophthora infestans y Colletotrichum sp. Grupo 3, S. quitoense x S. vestissimum, plantas resistentes a Fusarium oxysporum, y un 50,00% de las plantas son resistentes a M. incognita, también son plantas resistentes a Phytophthora infestans y Colletotrichum sp. El grupo 4, S. quitoense var. peluda x S. hyporhodium presentan un 24,00% de las plantas con F. oxysporum, y un 48.00% de las plantas resistentes a M. incognita, también fueron resistentes a P. infestans y Colletotrichum sp. Son materiales con características particulares que pueden ser utilizados en programas de mejoramiento.