El presente trabajo de investigación tiene como objetivo realizar el diagnóstico del estado actual de la microcuenca del rio Motolo y una propuesta de plan de manejo, además para determinar la calidad de agua del río de utiliza la normativa ambiental referente al TULAS, Anexo 1, Tabla 3 Criterios de Calidad admisibles para la preservación de la flora y fauna en aguas dulces, frías o cálidas, y en aguas marinas y de estuario. El área de influencia del proyecto se encuentra ubicada en la parroquia Shell, Cantón Mera, Provincia Pastaza, se consideró realizar este trabajo investigativo del río Motolo desde la entrada a la parroquia Shell hasta su desembocadura en el río Pindo Grande. Para el desarrollo de la investigación se realizó un recorrido a lo largo de los puntos de muestreo en donde se realizó las pruebas de muestreo en el río Motolo, los parámetros analizados en esta área fueron: parámetros físicos, parámetros químicos parámetros Biológicos. Se evidenció que la Calidad de Agua para la microcuenca del río Motolo varía de Media a Buena Calidad, se determinó a través del Índice de Calidad de Agua (ICA). Para la identificación de impactos se utilizó la matriz de identificación de impactos ambientales y la matriz de importancia para la microcuenca del río Motolo, los diferentes medios analizados (Bióticos, Abióticos y Socioeconómico), Se propuso un Plan de Manejo Ambiental para la conservación y mitigación de la microcuenca del río Motolo, estableciendo los siguientes programas: Programa de manejo de desechos sólidos (PMD), Programa de Infraestructura, Programa de reforestación de la microcuenca (PRM), Programa de Protección de áreas Naturales(PPAN)