Durante 1998 el Departamento de Protección Vegetal de esta Estación Experimental efectuó investigación en la determinación de la biología de la mosca blanca la que se ha presentado en algunas plantaciones en poblaciones significantes, se iniciaron estudios d la distribución de las moscas de las frutas, también se inició una investigación en cenicilla en mango, se ha continuado trabajando en los biocontroladores de las plagas del banano, biología de malezas, nematodos y control de malezas en soya. Al mismo tiempo se ha efectuado investigación en Sigatoka negra, nematodos y trips en banano con el apoyo financiero de la empresa privada como PROSUDRAGRO, AMS, Rhone Poulenc, AgrEvo, Ecuaquímica y Novartis del Ecuador. Además de efectuaron monitoreos de las plagas que están asociados con las flores tropicales, con le financiamiento de ASOFLEX….