Para el cumplimiento de los objetivos el Departamento Nacional de Protección Vegetal ha desarrollado proyectos de investigación específicos como: Epidemiología de patógenos, caracterización de problemas patológicos de las plantas de importancia socio económico, control biológico y cultural, control químico (de bajo impacto para la salud y el ambiente), identificación de la resistencia genética y desarrollo de bioplaguicidas; a fin de generar tecnologías de manejo integrado. Se ha dado impulso a los servicios de clínica y diagnosis, realizando análisis Micológicos, Bacteriológicos, Virológicos, Nematológicos, Microbiológicos, Micorrízicos y Control interno de calidad sanitaria de semilla de papa.