Este estudio permitió identificar vacíos en la colección de maíz (Zea mays), del Banco de Germoplasma del Instituto Nacional de Investigaciones Agropecuarias (INIAP), mediante el uso de las herramientas ELC y REPRESENTA del programa CAPFITOGEN. Se identificó seis categorías ecogeográficas, de las cuales las categorías 5 y 6 fueron las más frecuentes con 632 y 436 celdas de 5 x 5, respectivamente, y presentaron características ecogeográficas muy similares con temperaturas anuales promedio de 15,3°C, precipitación cuarto más cálido de 310 mm, elevación promedio de 2376 msnm, y un pH promedio de 6,5 ligeramente ácido. En lo relacionado a la ocurrencia, se observa vacíos geográficos en tres categorías, donde se debería realizar colectas suplementarias, esto es en las provincias de Carchi, Imbabura, Pichincha y Napo (Sierra y Amazonia de Ecuador). Las herramientas CAPFITOGEN permitieron identificar los vacíos de entradas (accesiones) lo cual permitirá mejorar la representatividad de la colección de maíz del banco de germoplasma del INIAP.