En Ecuador el tizón tardío (Phytophthora infestans), y el nematodo del quiste (Globodera pallida) constituyen dos limitantes que afectan la producción y la calidad de la papa. Para su manejo se realizan aplicaciones con pesticidas que afectan el ambiente, agricultores e incrementan los costos de producción. El desarrollo de nuevas variedades en el Ecuador se basa en el mejoramiento convencional, sin embargo, este método es largo y costoso. Para incrementar la eficiencia para el desarrollo de variedades, con el apoyo de la UE a través de la AECID, se plantea complementar el mejoramiento convencional, con la selección asistida por marcadores moleculares. El objetivo es generar germoplasma con resistencia/tolerancia a TT, NQ y calidad, a través del uso de marcadores moleculares para mejorar los procesos de selección de materiales y reducir el tiempo de generación de nuevas variedades. Componente 1: Se seleccionaron 17 progenitores, 8 para resistencia al TT, 5 para NQ 5 y 4 variedades para calidad. Se realizaron 88 cruzamientos y se han generado 2500 progenies. En laboratorio se validaron 3 marcadores moleculares asociados con resistencia a TT; para NQ los marcadores empleados no mostraron asociación. Componente 2: Se han evaluado 15 clones avanzados localidades representativas de las provincias de Pichincha, 14 en Tungurahua, 14 en Chimborazo y 10 en Carchi. Se han seleccionado seis con características de resistencia al TT, NQ y calidad. Componente 3: Se han elaborado tres publicaciones: 1) Mejoramiento genético de papa: Conceptos, procedimientos, metodologías y conceptos, 2) Guía del manejo de la punta morada de la papa, 3) Tríptico informativo. Documentos disponibles en el repositorio del INIAP: https://repositorio.iniap.gob.ec/.