Se presenta una alternativa a los métodos convencionales de muestreo, mediante detectores ultrasónicos, creando una biblioteca base de llamados de ecolocación de las especies de murciélagos de los bosques altoandinos Llaviuco y Mazán. Se emplearon dos tipos de micrófonos ultrasónicos, unidireccional y multidireccional, con los que se grabaron los llamados de cuatro especies: Anoura geoffroyi, Myotis oxyotus, Sturnira erythromos e Histiotus montanus. Los datos obtenidos se analizaron con el software Avisoft SasLab Pro, se promediaron las medidas de cada una de las especies para establecer diferencias entre ellas. Se pudieron distinguir dos tipos de canto diferentes para A. geoffroyi, H. montanus y S. erythromos mientras que M. oxyotus presentó tres tipos de canto distintos. Las diferencias encontradas tanto en las variables medidas como en las formas de las llamadas se muestran notables entre las especies, haciendo del método acústico de identificación una alternativa real y confiable.Biólogo con Mención en Ecología y Gestión