El presente estudio, realiza un análisis de la importancia que tiene establecer procedimientos formales de control interno en los procesos contables y cómo estos afectan en la presentación de la información económica-financiera de la PYMES de Bahía de Caráquez. Con la finalidad de cumplir con este objetivo, se aplicó un estudio con un enfoque cualitativo y de alcance descriptivo, el mismo que se enfocó en realizar una investigación bibliográfica relacionada con el control interno y los procesos contables. Para el levantamiento de la información, se procedió a diseñar un instrumento que permita recolectar información relevante, la misma que consistió en la aplicación de una encuesta a los colaboradores del área administrativa y contable a una muestra de 30 PYMES, de una población total de 34 PYMES de Bahía de Caráquez registradas en la base de datos de la Superintendencia de Compañías, Valores y Seguros, y con base en esta información se procedió a analizar los datos mediante el software estadístico SPSS. Dentro de los resultados obtenidos, se puede destacar que las pequeñas y medianas empresas de Bahía de Caráquez, no le dan la debida importancia a los procesos de control interno, considerando que no cuentan con manuales y flujos de procesos acordes a la normativa vigente, que permitan realizar un adecuado seguimiento a los procesos contables de esta organizaciones, afectando directamente al registro de las transacciones contables, puesto que al no contar con lineamientos definidos, afecta al proceso de ingreso de información, obteniendo como resultado información con bajos niveles de confiabilidad, dificultando la toma de decisiones administrativas.