Bats are mammals, they have an important role in the ecosystem, but in some cases, they are reservoirs of virus, bacteria and parasites. The objective of this investigation was the molecular detection of helminths (cestodes and nematodes) in 90 fecal samples of different food guilds on two areas: Tiputini Biodiversity Station and Manabí (Azuluna, Ayampe y Pto. Rico-Azuluna)...Los murciélagos son mamíferos pertenecientes al orden Quiróptera, cumplen un rol importante en los ecosistemas, siendo los principales dispersores de semillas, sin embargo, también pueden ser reservorios de virus, bacterias y parásitos. El objetivo de la presente investigación fue la detección molecular de helmintos (cestodos y nematodos) en 90 muestras de guano de diferentes gremios alimenticios de murciélagos en la estación de biodiversidad Tiputini y en 3 localidades de Manabí (Azuluna, Ayampe y Pto.Rico-Azuluna)...