Desde el 2003 se viene dando un proceso de reformulación de los reglamentos que inciden en el manejo forestal en la Amazonia, liderado por el Programa Nacional de Bosques. Un indicador del avance logrado por el sector se refleja en la superficie de bosques certificados en la región, que creció de menos de 100 mil ha en los años 1990 a 1,4 millones ha en el 2006. Entre los factores que han contribuido a la implementación del manejo forestal se destacan: la legislación que reglamenta el manejo forestal, la existencia de investigaciones sobre manejo forestal en la región, la certificación forestal y la diseminación del manejo forestal por medio de proyectos demostrativos, publicaciones, capacitación e introducción del tema en el debate ambientalista.