Mediante la implementación del modelo de cogestión ejecutado por el programa Focuencas II se han validado nuevas metodologías, enfoques y herramientas en la subcuenca del río Copán. El modelo ha generado conocimientos, experiencias y lecciones que bien pudieran replicarse en otros territorios. En este artículo se presentan las lecciones aprendidas por componente y algunas que forman parte integral del modelo en su conjunto. Se evidencia que para la consolidación y fortalecimiento de modelos innovadores de cogestión se requiere de una atención descentralizada hacia las instancias locales del territorio, de un enfoque de acción-investigación y de estrategias y acciones para el reforzamiento del modelo por parte de las autoridades locales.