Study of temporal variation of bird assemblages may be particularly important in highly dynamic ecosystems as fluvial wetlands to identify the factors that influence and contribute to the maintaining of regional diversity. We study temporal variation in regional bird species composition and richness and the factors that drive it in the fluvial system of the Paraná River in Argentina. We sampled birds on a regional scale by performing surveys during 2 years (2011-2013; 16 total surveys) at 60 sites located along the fluvial system. We recorded a total of 162 species and 12,738 individuals, with a mean of 72.7 ± 1.9 species and 796.1 ± 41 individuals per survey. Temporal beta diversity accounted for 57% of regional species richness. Bird composition varied seasonally because of the turnover (and not nestedness) of species between autumn-winter and spring-summer periods; migrant species contributed to but did not account for all these differences. Difference in bird composition between years was caused primarily by turnover of species within autumn-winter periods; that turnover was related to changes in water levels. Temporal variation in availability of habitats across the regional extent of the fluvial system accounted for the highest proportion of temporal beta diversity. Species richness did not vary seasonally nor was it related to fluctuations in water level or habitats. Our results showed that climatic seasonality and environmental dynamics of the fluvial system, as a function of water-level fluctuations and of variations in habitat availability, jointly influence regional composition of birds through temporal turnover of species. These variations in regional composition were not related to variations in regional species richness. These results show the importance of the natural dynamic of the fluvial system to conserve the processes that maintain the regional assemblage of birds.El estudio de la variación temporal de los ensambles de aves puede ser particularmente importante en ecosistemas altamente dinámicos como los humedales fluviales para identificar los factores que influencian y contribuyen al mantenimiento de la diversidad regional. Se estudió la variación temporal de la composición y riqueza regional de aves y los factores que conducen ésta en el sistema fluvial del río Paraná en Argentina. Se muestrearon aves a escala regional mediante la realización de muestreos durante 2 años (2011-2013; 16 muestreos en total) en 60 sitios localizados a lo largo del sistema fluvial. Se registraron un total de 162 especies y 12.738 individuos, con una media de 72.7 ± 1.9 especies y 796.1 ± 41 individuos por muestreo. La diversidad beta temporal dio cuenta del 57% de la riqueza regional de especies. La composición de aves varió estacionalmente debido al recambio (y no al anidamiento) de especies entre períodos otoño-invernales y primavero-estivales; las especies migrantes contribuyeron pero no dieron cuenta de estas diferencias. La diferencia de la composición de aves entre años fue debido al recambio de especies dentro de los períodos otoño-invernales; ese recambio se relacionó con variaciones en el nivel de agua del río. La variación temporal en la disponibilidad de hábitats a lo largo de la extensión regional del sistema fluvial dio cuenta de la más alta proporción de diversidad beta temporal. La riqueza de especies no varió estacionalmente ni se relacionó con las fluctuaciones en el nivel del agua o los hábitats. Los resultados mostraron que la estacionalidad climática y la dinámica ambiental del sistema fluvial, en función de las fluctuaciones en el nivel de agua y de las variaciones en la disponibilidad de hábitat, influenciaron conjuntamente la composición regional de aves mediante el recambio temporal de especies. Estas variaciones en la composición regional no se relacionaron con variaciones en la riqueza regional de especies. Estos resultados muestran la importancia de la dinámica natural del sistema fluvial para conservar los procesos que mantienen el ensamble regional de aves.