The possible effect of “El Niño” in the non-gelatinous zooplankton in Golfo Dulce, Pacific coast of Costa Rica during the period of 1997-1998. Non-gelatinous zooplankton was studied in Golfo Dulce, an embayment on the Pacific coast of Costa Rica, during the period 1997-1998. Five sampling stations were selected, representing different areas of the gulf. Previous to each zooplankton sampling, a 2 L Niskin bottle was used to collect water and determine water temperature, salinity, and dissolved oxygen throughout the water column at intervals of 10 m from the surface to a depth of 60-100 m. Temperature variation in the water column was used to locate the thermocline. A conical zooplankton net of 0.50 m in diameter and 153 μm mesh size, with a remote closing device in its mouth was used. Sampling included a vertical haul above the thermocline, one through it, and one below it at each station. Samples were fixed in 4 % formaldehyde. Later, a fraction was separated using a Folsom plankton splitter. In average, zooplankton abundance was 3 793 ± 4 867 ind/m3, with a significantly higher abundance in the upper layer of all stations (F= 66.7, p <0.05). The station with the highest abundance in the upper layer was GD-03 (n= 9 921 ±8 334 ind/m3). The mid layer showed relatively low densities, ranging between 1 585 ± 759 ind/m3 and 2 626 ± 3 102 ind/m3. The deep layer was relatively poor in zooplankton, with values that varied between 946 ± 1 069 ind/m3 and 1 307 ± 1 270 ind/m3. In general, the most abundant group during the study period was the copepods (71.47 %), followed by appendicularians (8.25 %), ostracods (7.99 %), invertebrate eggs (5.43 %), polychaete larvae (1.8 %), and chaetognaths (1.03 %). Cluster analysis indicated that the inner stations behaved differently from outer stations. The possible impact of the El Niño on the distribution, composition and abundance of the non-gelatinous zooplankton is discussed. Rev. Biol. Trop. 54 (Suppl. 1): 225-240. Epub 2006 Sept. 30.El zooplancton no gelatinoso fue estudiado en el Golfo Dulce, costa Pacífica de Costa Rica, durante el período 1997-1998. Cinco estaciones de muestreo fueron seleccionadas caracterizando diferentes áreas del Golfo. Previo a cada muestreo de zooplancton, una botella Niskin de 2 l fue usada para colectar agua y determinar la temperatura, salinidad y el oxígeno disuelto en la columna de agua en intervalos de 10 m, desde la superficie hasta los 60 o 100 m de profundidad. La variación en la temperatura del agua fue utilizada para estimar la posición de la termoclina. El muestreo de zooplancton se realizó usando una red de plancton cónica de 0.50 m de diámetro y 153 μm de tamaño de poro con un sistema de cierre remoto en su boca. El muestreo incluyó un arrastre vertical en la capa superior a la termoclina, uno a través de ésta y otro por debajo. Las muestras fueron fijadas en formaldehído al 4 %. Mas tarde, una fracción fue separada utilizando un separador de plankton Folsom y los organismos contados e identificados. La abundancia promedio de zooplancton fue de 3 793 ± 4 867 ind/m3, con abundancias significativamente mayores en la capa superior de todas las estaciones (F= 66.7, p <0.05). La estación con la mayor abundancia de zooplancton en su capa superior fue GD-03 (n= 9 921 ± 8 334 ind/m3). La capa intermedia mostró abundancias relativamente bajas, con valores promedio que fluctuaron entre 1 585 ± 759 ind/m3 (GD-11) y 2 626 ± 3 102 ind/m3 (GD-03) La capa más profunda mostró abundancias relativamente bajas de zooplancton, con valores promedio que fluctuaron entre 946 ± 1 069 ind/m3 y 1 307 ± 1 270 ind/m3. En general, el grupo más abundante durante el estudio fueron los copépodos (71.47 %), seguidos por las apendicularias (8.25 %), ostrácodos (7.99 %), huevos de invertebrados (5.43 %), larvas de poliquetos (1.8 %) y quetognatos (1.03 %). Un análisis de conglomerados indicó que las estaciones internas se comportan de manera distinta de las externas. El posible impacto del fenómeno de El Niño sobre la distribución, composición y abundancia del zooplancton no gelatinoso es discutido.