This work analyzes the applicability of of the multilevel analysis technique in health sciences in Costa Rica. The first section describes to the main aspects of the multilevel analysis, the advantages with respect to the classic methods and their applicability in health investigations. In the second part we present an example of application of multilevel logistic regression in the diabetic patients of the primary care. The example makes emphasis in the syntax for the aplication in the specialized statistical programs in the multilevel analysis, MLwiN 2,0, and the corresponding interpretation of the results.Este trabajo analiza la aplicabilidad de las técnicas de análisis multinivel en la investigación en salud en el ámbito costarricense. La primera sección describe los aspectos más relevantes del análisis multinivel, las ventajas que tiene con respecto a los métodos clásicos y su aplicabilidad en investigaciones en salud. En la segunda parte se presenta un ejemplo de aplicación de regresión logística multinivel en los pacientes diabéticos de atención primaria del sistema público de salud costarricense.  El ejemplo hace énfasis en la sintaxis para su replica en uno de los programas estadísticos especializados en el análisis multinivel, el MLwiN 2.0, y la correspondiente interpretación de los resultados.