The historiography on World War II in Puerto Rico brings different analyses on political, economic, military, and geographical topics. However, the environmental history analysis of the impact of policies established by the U.S. government on the island during this period has been meager. The implementation of new policies for military security purposes between 1939 and 1945 also brought an alteration of the island natural landscape that impacted large areas of the topography of the Puerto Rican archipelago. Thanks to a new paradigm in environmental historiography, the environmental effects of wars at the global level have been considered and in turn creates the conditions for reflection on the issue in comparing scenarios. That is why this essay aims to add the environmental analysis in a preliminary way to continue the study on this war and its effects. In addition, we tried to expose the historiographic changes that took place in the middle of the twentieth century in the middle of the Second War and under the Cold War in the Puerto Rican academy. But above all, it seeks to continue including the island to contemporary historiographic debates in the Greater Caribbean and Latin America.  La historiografía sobre la Segunda Guerra Mundial en Puerto Rico contiene análisis políticos, económicos, militares y geográficos. Sin embargo, el análisis histórico ambiental sobre el impacto de las políticas establecidas por el gobierno de los Estados Unidos en la Isla durante ese periodo ha sido exiguos. La implementación de nuevas políticas con fines de seguridad militar desde el 1939 hasta 1945, acarreó además una alteración del paisaje natural isleño que impactó grandes áreas de la topografía del archipiélago puertorriqueño. Gracias a un nuevo paradigma en la historiografía ambiental se ha tomado en consideración los efectos ambientales de las guerras a nivel global y a su vez, crea las condiciones para una reflexión sobre el asunto a manera de comparar y contrastar escenarios. Es por esa razón que, este ensayo aspira a sumarle el análisis ambiental de manera preliminar para continuar con el estudio sobre esta guerra y sus efectos. Además, intentamos exponer los cambios historiográficos que se llevaron a cabo a mediados del siglo XX en medio de la Segunda Guerra y bajo la Guerra Fría en la academia puertorriqueña. Pero, sobre todo, busca continuar incluyendo a la Isla a los debates historiográficos contemporáneos que se llevan a cabo en el Gran Caribe y en Latinoamérica.