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Genómica estructural para el análisis de péptido sintetasas no ribosomales en Xenorhabdus nematophila SC0516, una bacteria de nemátodos entomopatógenos
Autor
LUIS ENRIQUE ROJAS ESPINOZA
Resumen
Los insectos patógenos representan una fuente importante de novedosos productos
naturales, ya que producen una gran diversidad de moléculas con el fin de dominar a
sus presas y a los competidores de alimento. Para lograr dichos fines, incluso algunos
patógenos establecen alianzas con diversas bacterias (Bode, 2009). Eventos simila-
res ocurren en los nemátodos entomopatógenos del género Steinernema y Heteror-
habditis, que han establecido una relación simbiótica con bacterias de los géneros
Xenorhabdus y Photorhabdus, respectivamente. Se ha demostrado que estas bacte-
rias producen metabolitos secundarios muy variados, que pudiera estar relacionado
con su patogenicidad a insectos (Shi y Bode, 2018). La mayoría de estos metabolitos
secundarios se sintetizan mediante péptido sintetasas no ribosomales (o NRPSs, por
Non Ribosomal Peptide Synthetase), que son complejos multienzimáticos organiza-
dos de forma modular.
Los péptidos sintetizados por las NRPSs se caracterizan, a diferencia de los péptidos
sintetizados por el ribosoma, por contener componentes no proteicos que se presume
contribuyen a la versatilidad de su actividad biológica (Süssmuth y Mainz, 2017). En-
tre los péptidos que sintetizan las NRPSs se encuentran antibióticos, compuestos an-
ti-tumorales, inmunupresores, entre otros. Por esta razón, el estudio de las NRPSs es
de gran relevancia en la agricultura, en la medicina y en la investigación en general
(Martin y Gil, 1984).
Para encontrar nuevos péptidos y entender cuál es el papel de las NRPSs en la rela-
ción bacteria–nemátodo, se han utilizado diversas herramientas informáticas que
permiten el análisis de los genomas, el estudio de los genes potencialmente involu-
crados en el proceso simbiótico, y la asignación de posibles funciones biológicas, todo
ello encaminado a adquirir una compresión cada vez más completa de cómo las
NRPSs sintetizan estos compuestos bioactivos (Weber, 2014).