Los cloroplastos son los organelos encargados de llevar a cabo la fotosíntesis en plantas; estos evolucionaron a partir de bacterias fotosintéticas. Los cloroplastos contienen su propio ADN, en el cual se encuentran codificados genes necesarios para su funcionamiento. El genoma de los cloroplastos o plastoma se divide en cuatro regiones con características distintivas. El estudio de la secuencia, estructura y composición de los plastomas es una herramienta útil para la comprensión de la evolución tanto de plantas como de los cloroplastos mismos.