El complejo Encyclia adenocarpon está conformado por un grupo de especies que comparten caracteres morfológicos muy similares, lo que hace muy difícil diferenciarlas. Desde un punto de vista sistemático y evolutivo, el estudio de este complejo nos permitirá responder las siguientes preguntas: ¿Es el complejo monofilético? ¿Cuáles caracteres lo definen? ¿Cuántas especies lo componen, cuáles son sus límites y cuál es su estado de conservación? El uso de inferencia filogenética nos permitirá esclarecer estas interrogantes.