En el presente trabajo se muestran los resultados obtenidos en el desarrollo de un sistema electro-Fenton en donde se utilizó un electrodo de hierro como fuente de iones para promover la reacción de Fenton. Se evaluaron los arreglos del dispositivo electro-Fenton en uno y tres compartimentos, y en cada caso se comparó dirección de flujo ánodo–cátodo con inversión de polaridad. El sistema de tres compartimentos en un arreglo combinado de electrodos y con inversión de polaridad, promovió una mejor eficiencia del sistema y con ello se logró reducir la concentración de hierro en el efluente tratado.