Las plagas y enfermedades constituyen uno de los elementos limitantes dentro de la producción de cualquier cultivo. Entre las enfermedades de las plantas, los hongos son organismos que juegan un papel importante en la enfermedad de los cultivos, estos patógenos pueden causar considerables pérdidas económicas. Para el control, se utilizan plaguicidas químicos, los cuales causan daños a la biodiversidad de los ecosistemas donde se aplican, actualmente el uso de aceites y extractos de origen botánico son una buena alternativa para el control de estas plagas, teniendo en cuenta que son más nobles con el medio ambiente y la salud humana. El objetivo del presente estudio fue evaluar los efectos de los metabolitos secundarios Eucalyptol, ?-Citronellol, Limonene y Allyl-isotiocianato en el crecimiento micelial de Rhizoctonia solani, Phytophthora cinnamomi, Fusarium oxysporum, Pythium amazonianum, Alternaria solani y Phytopythium Vexans. Los PAB mostraron diferencias en los valores de porcentaje de inhibición en el crecimiento micelial de los seis hongos fitopatógenos. El extracto de citronelol fue el mejor producto que inhibió R. solani, P. amazonianum, P. cinnamomi, P. vexans, F. oxysporum y A. solani con 97.74, 97.85, 98.74, 93.21, 98.8 y 97.4%, respectivamente. A partir de los extractos utilizados, podemos considerar que algunos tienen un gran potencial para ser considerados como controladores de hongos fitopatógenos, también se pueden usar como controladores de enfermedades en cultivos de interés en la agricultura, aumentando los rendimientos de producción.