En el presente trabajo estudiamos las modificaciones generadas por la presencia de medios nucleares en los estados inicial y final de procesos que involucran hadrones. Realizamos el análisis en el contexto de QCD a segundo orden en el desarrollo perturbativo. Para ello efectuamos una descripción exhaustiva de la cinemática de procesos de dispersión inelástica profunda y colisiones hadrónicas en el vacío. A partir de esto analizamos la incidencia de los medios nucleares sobre la distribución de partones en nucleones ligados. Dicho estudio incluye una actualización de los análisis realizados hasta el momento, a saber la inclusión de efectos de masa por la presencia de quarks pesados, el agregado de nuevos resultados experimentales y el impacto de las modificaciones en las funciones de fragmentación debidas a la presencia del medio nuclear. Por otro lado investigamos también las modificaciones de estado final observadas por los experimentos de DESY y RHIC, y presentamos funciones de fragmentación nucleares, extraidas en forma consistente con la determinación de distribuciones partónicas. Empleando estos resultados, brindamos predicciones para experimentos a realizarse en el LHC, y en los futuros LHeC y EIC.