A Teoria da Agência oferece meios para o estudo dos problemas advindos da separação entre propriedade e controle, focando as relações entre aquele que detém a propriedade, e o agente a quem realiza a gestão. O objetivo desta pesquisa é verificar em Instituições de Ensino Superior do Sul do Brasil, como se apresenta a Teoria da Agência e se há evidencias da existência de Custos de Agência. Esse estudo caracteriza-se como qualitativo, pois se pretendeu compreender um fenômeno em contato direto com as informações da organização estudada. Na pesquisa, fez-se uso de técnica análise de conteúdo, pois se pesquisou com 8 gestores em uma entrevista semi-estruturada com o Diretor de Unidade que representa o agente nesta organização. Constatou-se há conflitos de interesses como também que os custos de agencia estão presentes, devido a empresa ter em sua cultura, a gestão por resultados e o monitoramento constante de indicadores de performance operacional e financeiros, porém visualizou-se que os contratos de resultados dão suporte a governança corporativa minimizam maiores conflitos entre agente e principal.