The biological control of pests & mites on peruvian agriculture was characterized by the intensive use of chemical pesticides. However, the decrease on yield and the emergence of resistance to pesticides have obligated to farmers to increase chemical pesticide use for plague control. This has caused environmental pollution, benefical insects death, persistence chemicals residues on fruits, acute and chronic toxicity risks, moreover an increase on production costs. The objectives of this research were to isolate and to characterize B. thuringiensis native strains, and) to evaluate entomotoxic potential against Spodoptera frugiperda. Were isolated 54 natives strains of Bacillus thuringiensis from peruvian agricultural soils. Microscopic morphology showed parasporal crystals characteristic of B. thuringiensis diversity. The strains were evaluated and confirmed with biochemistry and growing characteristic. The bioassays performed on Spodoptera frugiperda showed the strain BT-UNMSM-42 had the most efficient toxicity with 39,73% mortality to 50 μg/mL and 71,93% mortality to 250 μg/mL, with standard deviation 11,30 and 9,98; respectively.El control de plagas en la agricultura peruana se ha caracterizado por el uso intensivo de plaguicidas químicos; sin embargo, las pérdidas en el rendimiento y la aparición de resistencia en las plagas han llevado a los productores a incrementar el uso de plaguicidas. Este uso indiscriminado genera problemas de contaminación ambiental, muerte de la fauna benéfica, presencia de residuos químicos en los frutos, riesgo de intoxicaciones agudas y crónicas; además, incremento en los costos de producción. Los objetivos propuestos fueron aislar y caracterizar cepas de Bacillus thuringiensis de interés biotecnológico de suelos agrícolas peruanos, y evaluar su potencial entomotóxico frente a Spodoptera frugiperda. Se aislaron 54 cepas de Bacillus thuringiensis de 385 muestras de suelo agrícola de diferentes partes del país. Las observaciones microscópicas mostraron la presencia de cristales parasporales característicos. Las cepas aisladas fueron evaluadas y confirmadas en sus características culturales y bioquímicas. Los bioensayos realizados sobre Spodoptera frugiperda, mostraron que la cepa Bt-UNMSM-42 posee una toxicidad superior al resto de las cepas con una media de mortalidad de 39,73% con 50 μg/mL y de 71,93% para 250 μg/mL, con una desviación estándar de 11,30 y 9,98; respectivamente.