Este primer volumen ―parte de la colección Historia de la Universidad, y escrita por encargo del rector y el Consejo Universitario de 1947― revisa las tres fases de la vida histórica sanmarquina en el siglo XVI: religiosa, legalista y científica, cuyas presencias, a decir del autor, no se anulan entre sí. Por lo tanto, temas como la querella de los jesuitas, el culto religioso en esta casa de estudios, la enseñanza universitaria y la protectoría, y el problema social del indio, entre otros, se correlacionan de tal manera que la participación de los agentes sociales en cada uno de estos sucesos repercuten no solo en el espacio estudiantil, sino también en el ámbito nacional. De esta forma, Eguiguren sostiene la tesis de la universidad como espacio de formación de hombres que aportan a la sociedad y hacen frente a las disyuntivas del país.