Micro-evolución genómica de Helicobacter pylori

Abstract

La bacteria Helicobacter pylori (H. pylori), que coloniza de forma persistente el estómago humano, exhibe altos niveles de diversidad genética, por lo que es un modelo para estudiar el papel de la plasticidad genómica en un organismo procariote. H. pylori tiene un genoma dinámico que le permite adaptarse al ambiente de su hospedero. La comparación genómica permite determinar los reordenamientos y las relaciones evolutivas entre los diferentes genomas de H. pylori. En este estudio, las secuencias concatenadas del cromosoma principal de siete cepas de H. pylori (26695, J99, HPAG1, G27, P12, shi470, B38) y secuencias de la isla de patogenicidad se alinearon con el programa MAUVE con el objetivo de examinar el orden génico, la extensión de las regiones de ADN en común, el genoma de núcleo y el grado de relación entre ellos. Igualmente, se realizó un análisis del genoma ancestral, basado en la historia de las inversiones con el programa MGR, un análisis de los patrones de recombinación entre especies y un análisis filogénetico de los genes cagA y vacA.