Tesis
FilogeografÍa de Artibeus jamaicensis triomylus y Artibeus jamaicensis yucatanicus (chiroptera: phyllostomidae) de México
Fecha
28/01/2010Registro en:
Vargas Miranda, Bárbara. (2009). FilogeografÍa de Artibeus jamaicensis triomylus y Artibeus jamaicensis yucatanicus (chiroptera: phyllostomidae) de México. (Doctorado en Ciencias). Instituto Politécnico Nacional, Sección de Estudios de Posgrado e Investigación, Escuela Nacional de Ciencias Biológicas, México.
Autor
Vargas Miranda, Bárbara
Institución
Resumen
ABSTRACT: Artibeus jamaicensis is a common and important component of the mammalian biological diversity in the tropics of the New World, and exhibits a high morphological variation; therefore this species is considered a taxonomic complex. Despite all qualitative and molecular studies on this complex, it has not been possible to reconstruct the evolutionary relationships and natural history of his members. On the other hand, phylogeography is a discipline with the goal of recognize the demographic and historic processes that shaped population genetic structure; which allows to test the delimitation of evolutionary lineages and if the haplotypes have a common origin or belong to a single lineage. In this study was assessed the population genetic variation of populations of two subspecies of A. jamaicensis: A. j. triomylus and A. j. yucatanicus from Mexico, through the analysis of two mtDNA fragments (Cytochrome b and control region). The data set allowed assessing the genealogical relationships among haplotypes as well as population genetic structure of the genetic variability. An haplotype network was created trough statistical parsimony methods; then, to infer what processes better explains the haplotype distribution, nested clade phylogeographic analysis (NCPA) was performed. The analysis was also used to test if this species presents a phylogeographical pattern, and to determine the demographic history of this species. From 15 localities, 68 haplotypes out of 69 sequences of cytochrome b (612 bp) were obtained. Also, 50 haplotypes out of 84 sequences of the control region (391 bp) were obtained. The wide haplotype geographic distribution, low genetic diversity, high haplotype diversity, mismatch distributions and the absence of spatial genetic structure is congruent with the expectation of populations with a recent evolutionary history, which are consistent a rapid, past demographic expansion in the Pleistocene. Also, analysis of molecular variance (AMOVA) showed that there is no differentiation between eastern and western groups. Under the criterion of null hypothesis of no association between clades and population geographic distribution, the results are statistically significant (P<0.05) at four steps level as well as total cladogram. Nested clade phylogeographic analysis suggest that the geographical distribution of Artibeus jamaicensis in Mexico is explained by restricted gene flow with isolation by distance, and past fragmentation, followed by contiguous range expansion due the global climatic oscillation and the association of glacials cycles during Pleistocene. RESUMEN: Artibeus jamaicensis es un componente común e importante de la diversidad biológica de mamíferos en los trópicos del Nuevo Mundo y exhibe una alta variación en cuanto a sus características morfológicas, por eso esta especie es considerada un complejo taxonómico. A pesar de todos los estudios cualitativos y moleculares realizados, no ha sido posible reconstruir la historia natural y relaciones evolutivas de sus miembros. Por otra parte, la filogeografía es una disciplina que intenta reconocer los procesos demográficos e históricos que han moldeado la distribución geográfica actual de las poblaciones, lo que permite la delimitación de linajes evolutivos al probar si los haplotipos tienen un origen común y derivan de un solo linaje. En este trabajo se estimó la variabilidad genética de poblaciones de dos subespecies de A. jamaicensis: A. j. triomylus y A. j. yucatanicus de México, mediante el análisis de dos fragmentos de mtDNA (Citocromo b y región control). Con estos datos, se estableció las relaciones genealógicas entre los haplotipos encontrados y se determinó la estructura geográfica de la variabilidad genética. Una red de haplotipos fue creada por métodos de parsimonia estadística; después, para inferir cuales fueron los procesos que explican la distribución actual de los haplotipos, se realizó un análisis filogeográfico de clados anidados. Así mismo, se probó si esta especie presenta un patrón filogeográfico, y se determinó la historia demográfica de esta especie. De 15 localidades, se obtuvo un total de 68 haplotipos a partir de las 69 secuencias del citocromo b, con una longitud de 612 pb. Asimismo, de la región control 50 haplotipos de 84 secuencias fueron obtenidos, en un fragmento de 391 pb. La amplia distribución geográfica de los haplotipos, la baja diversidad genética, la alta diversidad haplotípica, las distribuciones no acopladas (mismatch distributions) y la ausencia de una estructura genética asociada a su distribución geográfica es congruente con la expectativa para poblaciones con una reciente historia evolutiva, las cuales son caracterizadas por una rápida expansión demográfica en el pasado, durante el Pleistoceno. Asimismo, el análisis molecular de varianza (AMOVA) mostró que no existe diferenciación dentro de los grupos del Este y del Oeste. Bajo el criterio de una hipótesis nula de no asociación de clados con la distribución geográfica de las poblaciones, los resultados muestran una asociación estadísticamente significativa (P<0.05) a nivel de cuatro pasos y cladograma total. El análisis de clados anidados sugiere que la distribución geográfica de A. jamaicensis en México puede ser explicada por un flujo de genes restringido con aislamiento por distancia y fragmentación en el pasado seguido por un rango de expansión contigua, debido a la oscilación climática global y la asociación de ciclos glaciales durante el Pleistoceno.