Secuenciación del genoma de un aislamiento severo del virus de la tristeza de los cítricos del noreste de México

Abstract

La secuenciación completa del genoma del VTC, ha abierto la puerta para hacer diversos estudios encaminados a prevenir los daños causados por este virus. En este trabajo el genoma de un aislamiento severo del virus de la tristeza de los cítricos (VTC) de México (CBG-VTC1.), fue completamente secuenciado. Los 19,300 nt del genoma se encuentran divididos en 12 marcos de lectura abierta (ORFs) codificando para 15 proteínas y dos regiones no traducibles (5´ y 3´ UTR). El primer ORF inicia en el nucleótido 108 con un tamaño de 9587 nt codificando para una poliproteína de 357 kDa., que contiene dos proteasas contiguas (P-PRO), una metiltransferasa (MTR), y una helicasa (HEL). El segundo ORF se traslapa en los últimos 55 nt de las proteasas y este codifica para una ARN polimerasa ARN-dependiente (RdRp) con un peso molecular de 47 kDa, cuya función es de replicación. Los ORFs del 2 al 10 codificaron 10 productos protéicos con un rango que va de los 6 a 65 KDa. El genoma CBG-VTC1 presentó una sintenia similar a los genomas ya reportados variando solamente de 2 a 74 nt en tamaño.