Se recolectaron raíces de zanahoria en el campo y mercado con el fin de aislar e identificar los hongos asociados con ellas y se determinaron los sitios de infección natural de diferentes hongos sobre la raíz. Dieciséis géneros fueron identificados y su patogenicidad fue aprobada colocando cada hongo sobre: la peridermis sin heridas, parénquima del periciclo, parénquima del floema y parénquima del xilema. La mitad del total de los hongos se asiló tanto en muestras del campo como en el mercado. Los sitios de infección natural más frecuentes fueron: la “corona”, final de la raíz principal y raíces laterales. En la pruebas de patogenicidad se manifestó una gradiente de resistencia que va desde un alto nivel en la peridermis hasta un bajo nivel en el parénquima del xilema. Sclerotinia sclerotiorum,  Sclerotium rolfsii, Fusarium tricinctum, F. nivale, F. solani, F. oxysporum, Fusarium sp., Trichoderma sp. y Gliocladium sp., penetraron directamente a través de la peridermis y también infectaron los otros tejidos. Geotrichum candidum, Rhizopus stolonifer, Verticillium sp., Penicillium sp. y Candida sp. no infectaron la peridermis, pero si mostraron patogenicidad en el parénquima del periciclo, floema y xilema. Phoma sp. y Mucor sp. solamente infectaron al parénquima del floema y xilema.Fungi from carrot roots collected in the field local market were isolated and identified. Sites of natural infection on the root were recorded. Sixteen genera were identified and their pathogenicity tested by  placing them on: not wounded periderm, pericyclic parenchyma, phloem parenchyma and xylem parenchyma. Half of the total fungi was isolated in both field and market samples. The most frequent natural infection sites were the crown, end of the tap root, and lateral roots. In the pathogenicity tests a gradient of resistance was shown varying from a very high level at periderm to a low level at the xylem parenchyma.  Sclerotinia sclerotiorum,  Sclerotium rolfsii, Fusarium tricinctum, F. nivale, F. solani, F. oxysporum, Fusarium sp., Trichoderma sp. y Gliocladium sp., all penetrated directly throught the periderm and also infected the other tissues. Geotrivhum candidum Rhizopus stolonifer . Verticillium sp., Penicillium so., and Candida sp. did no intect the periderm, but were pathogenic  to the pericyclic, phloem, and xylem parenchyma. Phoma sp. and Mucor sp. only infected phloem and xylem parenchyma.