Artigo de Periódico
Comparative genomics of Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 8 reveals the importance of prophages in the genetic variability of the species
Fecha
2020-02-19Registro en:
2314-4378
Autor
Isabelle Gonçalves de Oliveira Prado
Giarlã Cunha da Silva
Josicelli Souza Crispim
Pedro Marcus Pereira Vidigal
Moysés Nascimento
Mateus Ferreira Santana
Denise Mara Soares Bazzolli
Institución
Resumen
Actinobacillus pleuropneumoniae é o agente etiológico da pleuropneumonia suína. Atualmente, existem 18 sorotipos diferentes; o sorotipo 8 é o mais amplamente distribuído nos Estados Unidos, Canadá, Reino Unido e sudeste do Brasil. Neste estudo, os genomas de sete isolados clínicos de A. pleuropneumoniae sorotipo 8 foram comparados com os outros genomas de doze sorotipos. As análises dos genomas do sorotipo 8 resultaram em um conjunto de 2.352 sequências codificadoras de proteínas. Dessas sequências, 76,6% estão presentes em todos os sorotipos, 18,5% são compartilhadas com alguns sorotipos e 4,9% foram diferenciais. Essa porção diferencial foi caracterizada como uma série de sequências de proteínas hipotéticas e regulatórias: sequência do elemento móvel. A análise de sintenia demonstrou possíveis eventos de recombinação gênica e aquisição por transferência horizontal de genes (HGT) nesta espécie. Um total de 30 sequências relacionadas a prófagos foram identificadas nos genomas. Essas sequências representavam de 0,3 a 3,5% do genoma das cepas analisadas, sendo que 16 delas continham prófagos completos. A análise de similaridade entre as sequências completas do prófago evidenciou um possível HGT com espécies pertencentes à família Pasteurellaceae. Assim, elementos genéticos móveis, como os prófagos, são componentes importantes da porção diferencial do genoma de A. pleuropneumoniae e demonstram um papel central na evolução da espécie. Este estudo representa o primeiro estudo feito para entender o genoma do sorotipo 8 de A. pleuropneumoniae.