Artículo
Global phylogenomic novelty of the Cas1 gene from hot spring microbial communities
Fecha
2022-12-02Autor
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Universidad San Sebastián
Salgado, Oscar
Guajardo-Leiva, Sergio
Moya-Beltrán, Ana
Barbosa, Carla
Ridley, Christina
Tamayo-Leiva, Javier
Quatrini, Raquel
Mojica, Francisco J.M.
Díez, Beatriz
Institución
Resumen
The Cas1 protein is essential for the functioning of CRISPR-Cas adaptive systems. However, despite the high prevalence of CRISPR-Cas systems in thermophilic microorganisms, few studies have investigated the occurrence and diversity of Cas1 across hot spring microbial communities. Phylogenomic analysis of 2,150 Cas1 sequences recovered from 48 metagenomes representing hot springs (42–80°C, pH 6–9) from three continents, revealed similar ecological diversity of Cas1 and 16S rRNA associated with geographic location. Furthermore, phylogenetic analysis of the Cas1 sequences exposed a broad taxonomic distribution in thermophilic bacteria, with new clades of Cas1 homologs branching at the root of the tree or at the root of known clades harboring reference Cas1 types. Additionally, a new family of casposases was identified from hot springs, which further completes the evolutionary landscape of the Cas1 superfamily. This ecological study contributes new Cas1 sequences from known and novel locations worldwide, mainly focusing on under-sampled hot spring microbial mat taxa. Results herein show that circumneutral hot springs are environments harboring high diversity and novelty related to adaptive immunity systems.
Materias
Ítems relacionados
Mostrando ítems relacionados por Título, autor o materia.
-
Guía infográfica de las aves del campus de la Pontificia Universidad Javeriana : Sede central
Echeverry-Galvis, Maria Angela; Cortés Cano, Juan Sebastián; Juan Sebastián, Sergio Andrés; Zapata Montoya, Sebastián; Botiva, Daniel Yesid; Linero, Daniela; Orozco, Daniela; Medina, Juan Sebastián; Sánchez, Juan Sebastián; Zuluaga, Juliana; Gómez, Laura María; Erazo, Paula Andrea; Ortegón, Salomé; Niño, Stephanie; Bocanegra, Valentina; Cardona, Valentina; Rincón, Víctor Julio; Moreno, Johan Sebastian; Jiménez, ValeriaEn las áreas urbanas las aves les dan a los ciudadanos un contacto directo con la vida silvestre. Su presencia es esencial para la polinización de jardines y huertas urbanas, para el control de poblaciones de roedores y ... -
Guía infográfica de las aves del campus de la Pontificia Universidad Javeriana : Sede central
Echeverry-Galvis, Maria Angela; Cortés Cano, Juan Sebastián; Juan Sebastián, Sergio Andrés; Zapata Montoya, Sebastián; Botiva, Daniel Yesid; Linero, Daniela; Orozco, Daniela; Medina, Juan Sebastián; Sánchez, Juan Sebastián; Zuluaga, Juliana; Gómez, Laura María; Erazo, Paula Andrea; Ortegón, Salomé; Niño, Stephanie; Bocanegra, Valentina; Cardona, Valentina; Rincón, Víctor Julio; Moreno, Johan Sebastian; Jiménez, ValeriaEn las áreas urbanas las aves les dan a los ciudadanos un contacto directo con la vida silvestre. Su presencia es esencial para la polinización de jardines y huertas urbanas, para el control de poblaciones de roedores y ... -
Niveles de empatía en estudiantes de Odontología de la Universidad San Sebastián, Concepción, Chile
Universidad San Sebastián; Universidad San Sebastián; Universidad San Sebastián; Torres-Martínez, Pilar Alejandra; Barrios-Penna, Carolina Alejandra; Fonseca-Molina, Juan Fernando; Díaz-Narváez, Víctor Patricio; González-Cruz, Sebastián Alejandro (2017)Introduction: The training of future dentists should consider developing empathy while they are still students. The first step to consider such training is to assess empathic behavior. Objective: To measure levels of empathy ...