Estudio cinético de la unión entre los factores de iniciación IF1 e IF3 con la subunidad ribosomal 30S de Escherichia coli en presencia de Tigeciclina y Demeclociclina

Abstract

Estudia la cinética de unión de IF1 e IF3 a la subunidad ribosomal 30S de E. coli en presencia de 2 tetraciclinas, Demeclociclina y Tigeciclina. Los datos cinéticos y estructurales obtenidos por métodos bioquímicos y computacionales determinaron el impacto de estos antibióticos en la fase de la iniciación de la traducción bacteriana. Los resultados indicaron que ambos antibióticos compactaron los dos dominios de IF3 al unirse al complejo 30S-IF3. Así como también redujeron la constante de disociación de IF1 en la mayoría de los complejos. El efecto de estabilización fue mayor en presencia de Tigeciclina debido a que redujo la velocidad de unión de la subunidad 50S al 30S IC y a su vez retuvo a IF1 en el complejo 70S IC en los últimos pasos. Sin embargo, Demeclociclina no jugó un rol muy importante en estas últimas etapas. El modelamiento estructural de ambas tetraciclinas unidas al 30S PIC y 30S IC mostraron importantes interacciones moleculares que podrían explicar la estabilización de IF1 por estos antibióticos, como es el caso de Tigeciclina, el cual expuso nuevos potenciales contactos con IF1 en el 30S IC. Estos resultados permitieron concluir que las tetraciclinas inducen a cambios conformacionales de IF3 e incrementan la afinidad de IF1, perturbando su correcta eyección durante la formación del complejo 70S y así retrasando la iniciación de la traducción bacteriana.