El zooplancton gelatinoso ha sido poco investigado en el Sistema de la Corriente de California (SCC) a pesar de que alcanza altas abundancias, su influencia ecológica y cambios de distribución. Durante el 2010 se presentó un evento climatológico de La Niña y durante el 2015-2016 un evento El Niño . Ambos han sido considerados de los más intensos para el SCC en los últimos años, provocando anomalías de temperaturas hasta de 3°C, así como alteraciones oceanográficas y biológicas en el sur del SCC. Con el objetivo de comparar a la comunidad de zooplancton gelatinoso durante diferentes condiciones climáticas se escogieron tres cruceros realizados en otoño de diferentes años: en 2001 (neutro), La Niña 2010 y El Niño 2015, en la región norte frente a Baja California. La comparación de la comunidad de zooplancton gelatinoso se realizó mediante métodos estadísticos multivariados no paramétricos, además se asoció la comunidad específica de cada año con variables ambientales (temperatura, salinidad, gradiente de densidad, oxígeno disuelto, profundidad de la termoclina) y biológicas (clorofila y abundancia de copépodos y larvas de peces). Se reportó una alta diversidad de zooplancton gelatinoso durante los tres años (89 taxones). La mayor diversidad se encontró durante el año neutro, y la mayor abundancia durante La Niña debido a dos especies cosmopolitas (Liriope tetraphylla y Dolioletta gegenbauri). El análisis de agrupamiento de dos vías indicó que durante los tres años la comunidad de zooplancton gelatinoso cambió significativamente. El análisis de escalamiento no métrico multidimensional confirmó estos agrupamientos e indicó que el calentamiento y estratificación de la columna de agua fueron las variables ambientales más influyentes en la comunidad de zooplancton gelatinoso durante El Niño 2015. Se observaron cambios de distribución, con extensión hacia el sur de la especie templada Pegea socia durante La Niña 2010. Desplazamiento hacia el norte de las especies tropicales y subtropicales como Aglaura hemistoma, Lensia fowleri y Thalia democratica, relacionados con la presencia de contraflujo hacia el polo durante El Niño 2015. El zooplancton gelatinoso es un grupo que responde rápidamente a los cambios oceanográficos en el SCC y afecta la ecología de la región de estudio.Gelatinous zooplankton from the California Current System (CCS) has been rarely studied despite its high abundance, ecologic influence and broad distribution changes reported in the world oceans. During 2010 occurred a La Niña event and during 2015 an El Niño event. They are among the most intense climatic events reported to CCS during the last twenty years, causing anomalies in temperature up to 3°C, and oceanographic and biologic perturbations in the south of the CCS. The goal of the present study is to compare gelatinous zooplankton community under different climatic conditions selecting three oceanographic cruises carried out in autumn of different years: 2001 (neutral), La Niña 2010 and El Niño 2015, off north Baja California. The comparison of the gelatinous zooplankton community among years was done using non-parametric multivariated methods, and also associated with abiotic (temperature, salinity, density gradient, dissolved oxygen, deep of the thermocline) and biological variables (chlorophyll-a concentration and prey density of copepods and fish larvae). A high diversity was observed integrating the three years (89 taxa), with the highest diversity observed during the neutral year and the highest abundance during La Niña event due the presence of two cosmopolitan species (Liriope tetraphylla and Dolioletta gegenbauri). The two-way cluster analysis showed significant changes in the gelatinous zooplankton community and the no-metric multidimensional analysis confirmed the clusters and indicated that the warming and stratification of the column water were the most influential environmental variables to explain changes of gelatinous zooplankton during El Niño 2015. Changes in distribution were observed for the temperate species Pegea socia extending southward during La Niña 2010. Displacements to the north occurred for the tropical and subtropical species Aglaura hemistoma, Lensia fowleri and Thalia democratica associated with the presence of anomalous poleward current. Gelatinous zooplankton respond rapidly to oceanographic changes in CCS and may even modify the ecology of the study region.