Thesis
Análisis comparativo de los métodos de detección de PCR y antígeno viral para SARS-CoV-2
Fecha
2021Registro en:
BCIEQ- T- 0679
Autor
Chinlle Carrasco, Melissa Mabel
Navarro Figueroa, Tanya Geovanna
Institución
Resumen
El SARS-CoV-2 es un betacoronavirus altamente infeccioso a las vías respiratorias de los seres humanos y se ha extendido rápidamente por todo el mundo, ante ello sus técnicas de detección como RT-PCR, antígeno viral son pruebas que sirven para el reconocimiento del virus. Por ello, en este trabajo investigativo se analizó los métodos directos de detección RT-PCR, antígeno viral en muestras de hisopado nasofaríngeo tomadas a pacientes con sintomatología similar al COVID-19 de un Laboratorio Clínico de la ciudad de Guayaquil en un periodo comprendido de abril a mayo 2021, de las cuales se evaluó las muestras n=59 (Proveedor A); n=31 (Proveedor B) por tecnología Electroquimioluminiscente (ECLIA) y n=20 (Proveedor C); n=25 (Proveedor D) por inmunoensayo de flujo lateral (IFL) frente a RT-PCR, utilizando la tabla de contingencia 2x2. Los resultados obtenidos fueron que las muestras analizados por ECLIA obtuvieron una sensibilidad 96% y especificidad
91%, k=0.86 (Prov-A) mientras que la del prov-B su sensibilidad y especificidad del
100%, k=1. Sin embargo los ensayos IFL del prov-C se obtuvo una sens=17%, esp=100%, k=0.218 y para el Prov-D su sens=44% y esp=88%, k=0.34. En conclusión se evidenció que las pruebas con tecnología ECLIA son efectivas para la detección del SARS-CoV-2 frente a RT-PCR, pero no ocurre lo mismo con los ensayos IFL ya que su sensibilidad y especificidad se hayan por debajo de los requisitos de rendimiento que indica la OMS, Sensibilidad ≥80% y Especificad ≥97%. SARS-CoV-2 is a highly infectious betacoronavirus to the respiratory tract of human beings and has spread rapidly throughout the world, in view of this its detection techniques such as RT-PCR, viral antigen are tests that serve for the recognition of the virus. For this reason, in this research work, the direct detection methods RT- PCR, viral antigen in nasopharyngeal swab samples taken from patients with symptoms similar to COVID-19 from a Clinical Laboratory in the city of Guayaquil in a period comprised of April, were analyzed to May 2021, of which the samples were evaluated n = 59 (Provider A); n = 31 (Provider B) by Electrochemiluminescent technology (ECLIA) and n = 20 (Provider C); n = 25 (Provider D) by lateral flow immunoassay (IFL) against RT-PCR, using the 2x2 contingency table. The results obtained were that the samples analyzed by ECLIA obtained a sensitivity of 96% and specificity of 91%, k = 0.86 (Prov-A) while that of prov-B had its sensitivity and specificity of 100%, k = 1. However, the IFL tests of prov-C obtained a sens = 17%, esp = 100%, k = 0.218 and for Prov-D its sens = 44% and esp = 88%, k = 0.34. In conclusion, it was shown that tests with ECLIA technology are effective for the detection of SARS-CoV-2 against RT-PCR, but the same is not the case with IFL assays since their sensitivity and specificity are below the performance requirements indicated by the WHO, Sensitivity ≥80% and Specified ≥97%.