Caracterización filogenética molecular de secuencias sobre genes de siete cepas de Ralstonia solanacearum

Abstract

Los cultivos del género Musa spp. tienen gran importancia en el Ecuador, sin embargo, están expuestos a varios patógenos como la enfermedad del Moko, causado por el patógeno Ralstonia solanacearum. Esta especie es muy variable posee amplia gama de huéspedes y una extensa distribución geográfica, la diversidad de esta especie se puede clasificar en varios filotipos. En este trabajo se analizaron las secuencias amplificadas por los genes ITS, egl y hrpB, de siete cepas de R. solanacearum asociadas a la enfermedad del Moko en Ecuador, determinando su filotipo por medio del método de construcción filogenética de Neighbor-joining. Las cepas de este estudio tuvieron un alto porcentaje de identidad con relación a otras especies de R. solanacearum. Mediante el análisis filogenético se determinó que las siete cepas pertenecían al filotipo II de R. solanacearum. Además, los análisis filogenéticos clasificaron a las cepas en dos subgrupos distintos, que coincidían con la cepa Po82 y CFBP2957, teniendo dos grupos genéticos diferentes.

The Crops of the genus Musa spp. are very important in Ecuador, however, it is exposed to various pathogens such as Moko's disease, caused by the pathogen Ralstonia solanacearum. This species is highly variable, it has a wide range of hosts and an extensive geographical distribution, the diversity of this species can be classified into several phylotypes. In this work, the sequences amplified by the ITS, egl and hrpB genes of seven strains of R. solanacearum associated with Moko disease in Ecuador were analyzed, determining their phylogenetic method using the Neighbor-joining phylogenetic construction method. The strains in this study had a high percentage of identity in relation to other species of R. solanacearum. By phylogenetic analysis it was determined that the seven strains belonged to the phylotype II of R. solanacearum. Furthermore, the phylogenetic analyzes classified the strains into two different subgroups, which coincided with the Po82 and CFBP2957 strain, having two different genetic groups.