dc.contributorVirna Cedeño Escobar
dc.creatorPortilla Merino, Vanessa Lucia
dc.date.accessioned2018-01-18T13:50:50Z
dc.date.accessioned2023-03-09T14:06:54Z
dc.date.available2018-01-18T13:50:50Z
dc.date.available2023-03-09T14:06:54Z
dc.date.created2018-01-18T13:50:50Z
dc.date.issued2016-12
dc.identifierPdf
dc.identifierhttp://repositorio.ug.edu.ec/handle/redug/24497
dc.identifier.urihttps://repositorioslatinoamericanos.uchile.cl/handle/2250/6055871
dc.description.abstractLas orquídeas (Orchidaceae) constituyen uno de los grupos de plantas más diversos en el planeta con más de 25.000 especies. La mayor diversidad de especies se encuentra en los Andes de Colombia y Ecuador. Entre ellas Cyrtochilum macranthum es considerada como la orquídea emblemática de la Provincia del Pichincha. Sin embargo, actualmente se ve afectada por la elevada recolección y por la destrucción de su hábitat. Se han emprendido estrategias orientadas a potenciar su cultivo in vitro para reducir la presión al medio natural. Un componente fundamental para su cultivo lo constituyen las comunidades microbianas de la ectorizósfera que cumplen un rol prioritario en la fisiología y desarrollo de la planta. En este contexto, el presente trabajo estuvo orientado a la caracterización de la microbiota, bacteriana y fúngica, de la ectorizósfera de poblaciones de C. macranthum silvestres y de invernadero. Se realizaron análisis de metagenómica dirigida a la región V4 del gen ARNr16S, para bacterias, y la región ITS1-5.8S-ITS2 para hongos con secuenciación de próxima generación. Se determinó que en las poblaciones silvestres, las bacterias más abundantes pertenecieron al Filo Proteobacteria con predominancia de Conexibacter spp, Bradyrhizobium spp, Acidobacterium spp. En las poblaciones de invernadero, el Filo más abundante fue también Proteobacteria con predominancia de los géneros: Opitutus, Nitrosovibrio, Nannocystis, Haliangium, Acidobacterium, Rhodoplanes. Se identificaron las especies: Opitutus spp, Nannocystis spp, Haliangium spp, NItrosovibrio spp. En las poblaciones de invernadero, el Filo de hongos más abundante fue Basidiomycota; con predominancia de los géneros Ceratobasidium, Epicoccum y Rhizoctonia, y las especies Neonectria sp, Mortierella sp, Ilynectria sp, Volutella ciliata sp. En las poblaciones silvestres, el filo más abundante fue Basidiomycota, con los géneros Serendipita y Ceratobasidium y las especies Ceratobasidium sp. y Mortierella sp. Análisis de las diferentes especies identificadas permitieron establecer la presencia de especies fijadoras de nitrógeno, degradadoras de materia orgánica, hongos micorrícicos involucrados en la germinación de la semilla, entre otros. Se requerirá continuar analizando la información sobre los diferentes microorganismos identificados para establecer su utilidad en el cultivo de Cyrtochilum macranthum, así como en otras especies de orquídeas. Subsiguientes análisis proteómicos y metabolómicos podrán ampliar la información sobre los microbiomas de la rizósfera de orquídeas, sus principales funciones e impacto sobre la salud y enfermedad de la planta.
dc.languagespa
dc.publisherUniversidad de Guayaquil. Dirección de Posgrado. Maestria en Biotecnología Molecular
dc.rightsopenAccess
dc.subjectMetagenómica, ectorizósfera, diversidad microbiana, bioinformática, microbiota, interacción planta-microbio.
dc.title“ANÁLISIS METAGENÓMICO COMPARATIVO DE LA MICROBIOTA ECTORIZOSFÉRICA DE POBLACIONES SILVESTRES Y DE INVERNADERO DE LA ORQUÍDEA CYRTOCHILUM MACRANTHUM (LINDLEY) KRAENZEL.”
dc.typeOther


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