proyecto
Oncoprecise: Plataforma para Asistencia en la Toma de Decisiones Basada en Análisis Multi-ómico Integrado a Aprendizaje Profundo a Partir de Biopsia Líquida en Pacientes con Cáncer de Mama
Registro en:
17EURE-72441
2017-72441-INNOVA_PRODUCCION
Autor
Claudia Andrea Gotschlich Stoffel
Centro de Bioinformática Datagen Spa
Institución
Resumen
Desarrollo de un Mínimo Producto Viable (mpv) para la Captura de la Información y la Incorporación a la Base de Datos en Oncoprecise. Implementación de Plataforma Automatizada de Procesamiento de los Datos con Conexión a Entornos de Cómputo de Alto Rendimiento para Implementación de Back-end Oncoprecise. Integración de Datos Genómicos desde Pacientes con Cáncer de Mama en Plataforma Oncoprecise. Integración de Datos Metabolómicos desde Pacientes con Cáncer de Mama en Plataforma Oncoprecise. Integración de Referencias Cruzadas desde Bases de Datos Relacionadas a Oncoprecise. Integrar los Datos de Ensayos Clínicos Metabólicos y Secuenciación del Transcriptoma por Herramientas de Nueva Generación (ngs) desde Biopsias Líquidas de Pacientes con Cáncer de Mama en una Plataforma Informática para la Toma de Decisiones Médicas en Diagnóstico Temprano Clasificación y Sugerencia de Tratamiento Farmacológico. El Cáncer de Mama es Actualmente la Forma Más Común de Cáncer en el Mundo. Existen Varios Subtipos Histológicos y Moleculares por lo que Precisa de Evaluaciones Clínicas Constantes y Tratamientos Individualizados. Una Vez Detectado la Correcta Caracterización Diagnóstica de la Enfermedad es Clave para un Tratamiento Óptimo. La Detección Precoz del Cáncer de Mama Tanto de Tumores Primarios como de Recaídas es un Factor Muy Importante en el Tratamiento ya que Condiciona Sustancialmente la Posibilidad de Supervivencia del Paciente. Así Mismo el Conocimiento Previo del Grado de Respuesta al Tratamiento es Otro Factor Clave a la Hora de Afrontar la Planificación y Administración de la Terapia Antitumoral. A Pesar de los Múltiples Avances Conseguidos el Cáncer de Mama Aún Presenta una Elevada Mortalidad ya que Aproximadamente un 30% Son Recurrentes y un Gran Porcentaje Desarrolla Metástasis. Si Bien hay Herramientas Diagnósticas para Clasificar el Tipo de Cáncer de Mama (técnicas Invasivas) Estas Herramientas No Lograr Realizar un Diagnóstico Precoz No Lograr Predecir el Curso de la Patología o como Va a Ser la Respuesta a la Terapia. Por ello es Necesario Seguir Investigando en la Obtención de Nuevos Métodos de Diagnóstico Precoz Vinculados a Terapias Individualizadas Basadas en un Mejor Conocimiento de Perfiles Moleculares. Las Siguientes Oportunidades Refuerzan Nuestra Propuesta como la Utilización de Plataformas de Aprendizaje Computacional Profundo para Resolución de Sistemas Complejos la Caracterización Metabolómica y Genómica de los Tumores la Caracterización Molecular desde Sistemas de Alto Flujo para la Adquisición de Datos Masivos el Desarrollo de Medicina Personalizada y Farmacogenómica para la Propuesta de Tratamiento Oncológico y la Reducción de los Costos de Plataforma de Adquisición de Datos de Alto Flujo. Este Último es Fundamental para Permitir el Costo-oportunidad del Servicio Ofrecido. En este Contexto se Enmarca el Presente Proyecto cuyo Objetivo Principal es Integrar los Datos de Ensayos Clínicos Metabólicos y Secuenciación del Transcriptoma por Herramientas de Nueva Generación (ngs) desde Biopsias Líquidas de Pacientes con Cáncer de Mama en una Plataforma Informática para la Toma de Decisiones Médicas en Diagnóstico Temprano Clasificación y Sugerencia de Tratamiento Farmacológico. Esta Integración Sería Efectiva a Través de la Colaboración de Dos Empresas Atrys Health S. A. De España Expertos en Telemedicina y Diagnóstico Molecular, en Conjunto con la Empresa Centro de Bioinformática Datagen Spa de Chile con Experiencia en Bioinformática Informática y Desarrollo de Plataformas para la Salud. Esta Integración se Entregaría a Través de un Servicio en Plataforma para la Asistencia en la Toma de Decisiones Basada en Análisis Multi-ómico Integrado a Aprendizaje Profundo a Partir de Biopsia Líquida desde Pacientes con Cáncer de Mama. Este Servicio de Asistencia Permitiría el Diagnóstico Precoz desde una Muestra No Invasiva con Integración de Evaluación de Miles de Parámetros en una Plataforma Computacional. Nuestros Clientes Serían la Población de Riesgo de Padecer de Cáncer de Mama Proceso Denominado Pesquisa este Posee un Componente Genético y un Componente Hereditario la Población en Riesgo Son Mujeres desde los 40 Años de Edad, los Pacientes que Requieran un Re-diagnóstico para Ver Susceptibilidad a Tratamientos y Pronóstico, y el Sistema Público de Salud y las Fundaciones de Ayuda al Paciente Oncológico. Segu´n Estimaciones de Globocan 2012 durante el An~o 2012 se Diagnosticaron Poco Ma´s de un Millo´n y Medio de Nuevos Casos de Ca´ncer de Mama a Nivel Mundial con una Tasa Estandarizada de 43. 3 por 100 Mil Mujeres y Fallecieron 521. 817 Mujeres por Esta Causa Alcanzando una Tasa Estandarizada por Edad de 129 por 100. 000 Mujeres. en la Unión Europea este Número Puede Superar los 390000 en España los 25000 y en Chile los 3500 Pacientes Diagnosticados al Año. Esperamos la Validación Clínica y Técnica de Esta Plataforma Oncoprecise para Chile y España. Que Representa la Integración de las Tecnologías de Análisis Masivo desde Biopsias Líquidas y el Uso de Algoritmos de Inteligencia Artificial para Reconocer Patrones desde Estos Datos y Lograr Asertividad en el Diagnóstico Clasificación y Tratamiento. Para Disminuir el Costo de la Utilización de Estas Herramientas Hacer los Análisis Más Accesibles a la Población Chilena Incorporar el Componente Genómico Hispano y Reducir la Mortalidad de Cáncer de Mama con Diagnósticos Más Precisos y en Estadios Tempranos de la Enfermedad. Corporación de Fomento de la Producción