El Proyecto Educativo Institucional (PEI) es el principio ordenador de las instituciones Educativas. En él, está plasmado el marco teórico, bajo el cual, surgen los objetivos pedagógicos; se presenta la "Visión" de la Institución. También se explícita la "Misión", que no es otra cosa que el propósito general del establecimiento educacional. Desde un punto de vista más global el PEI es como la carta presentación de una institución ante la sociedad, como define sus principios y valores tanto morales como académicos, sus metas y objetivos y los recursos y acciones para concretarlo. Es un proceso de cambio social y participativo que requiere de decisiones contextualizadas de acuerdo a la institución; su propia dinámica, realidad y entorno. Desde esta percepción cada establecimiento educacional manifiesta el tipo de ciudadano que pretende insertar en la sociedad. Dada la transversalidad de la clase de religión y su aporte a la integridad del ser humano, en cuanto le permite conectarse con su trascendencia y con los demás, es que en la mayoría de los establecimientos educacionales se imparte la asignatura.