O efeito atmosférico está presente na aquisição de uma imagem de satélite, e por consequência, os índices físicos tais como: NDVI, NDWI e NDBI devem ser também influenciados. Pode-se então, utilizar métodos para diminuir os efeitos produzidos pela atmosfera nas imagens. Entre os vários métodos, o Dark Object Subtraction (DOS) é considerado um dos mais simples. Este trabalho apresenta a comparação de índices físicos com a correção e sem a correção DOS, em imagens do sensor TM do Landsat 5. A área de estudo é um recorte espacial do reservatório de Itaparica, localizado na região da Bacia do Rio São Francisco, margeando municípios do estado da Bahia e de Pernambuco. Utilizou-se o software livre Quantum GIS para se obter os índices físicos com e sem a correção atmosférica. Foi feita uma amostragem de 12 pontos escolhidos na área de estudo que serviram de base na comparação dos índices NDVI, NDWI e NDBI. A partir deste estudo, podemos concluir que existem diferenças no resultado com e sem a aplicação da correção atmosférica. Observou-se que esta diferença não é constante e tem-se também valores distintos para cada alvo supondo um mesmo índice.